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Factura electrónica B2B en Shopify España: Todo sobre Verifactu

Desde el 1 de enero de 2026, la facturación electrónica B2B deja de ser opcional en España. Verifactu (Verificación de Facturas mediante el Registro de Facturas Electrónicas Telemático) es el sistema obligatorio regulado por el Real Decreto 1007/2023 y la Ley 11/2021 de medidas para la prevención del fraude fiscal. Todos los merchants Shopify con actividad en España deben cumplir con esta normativa, independientemente de su volumen de ventas. Esta guía te explica qué es Verifactu, cómo afecta a tu tienda Shopify, qué soluciones existen actualmente y cuál es tu calendario de implementación. La clave está en anticiparte: aunque el plazo obligatorio es 2026, la Agencia Tributaria ya acepta registros voluntarios desde hace meses.

¿Qué es Verifactu y por qué es obligatorio?

Verifactu es un sistema de registro telemático gestionado por la Agencia Tributaria que centraliza todas las facturas emitidas en España. No es una plataforma donde emites facturas: es un registro donde **debes comunicar** cada factura que generas (datos básicos: número, fecha, importe, NIF emisor/receptor).

Su propósito es detectar fraude fiscal en tiempo real, especialmente en cadenas de facturación. En lugar de que Hacienda revise facturas después (auditorías), ahora tiene visibilidad inmediata.

**Normativa aplicable:** - Real Decreto 1007/2023 (modifica el régimen de IVA y facturación) - Ley 11/2021 de medidas antifraude - Resolución de 16 de octubre de 2023 de la AEAT (instrucciones técnicas)

**Aplica a:** - Empresas y autónomos con actividad económica en España - Todas las transacciones B2B (empresa a empresa) - Obligación solidaria: tanto emisor como receptor deben reportar

Calendario de implementación: ¿Desde cuándo me afecta?

La implementación es gradual según facturación anual:

**Fase 1 (1 enero 2026):** Empresas con ingresos >3 millones € anuales deben registrar todas las facturas emitidas y recibidas.

**Fase 2 (1 julio 2026):** Empresas con ingresos entre 600.000 € y 3 millones € anuales.

**Fase 3 (1 enero 2027):** Autónomos y pequeñas empresas con cualquier nivel de ingresos.

**Para merchants Shopify en España:** Si vendes principalmente B2B (a otras empresas), tu tienda Shopify genera facturas que deben comunicarse a Verifactu. Si eres autónomo o PYE, entra en la Fase 3 (enero 2027), pero puedes adherirte voluntariamente antes. La Agencia Tributaria ya acepta registros voluntarios desde octubre de 2023.

**Ventaja de adelantarse:** Los datos registrados ahora cuentan como histórico, lo que facilita auditorías futuras y reduce riesgos de inconsistencias.

¿Cómo funciona Verifactu técnicamente?

Verifactu no sustituye tu software de facturación: **funciona en paralelo**. Aquí está el flujo:

1. **Tu tienda Shopify genera una factura** (a través de Shopify nativo o una app de facturación integrada). 2. **Se reporta automáticamente a Verifactu** (si tienes integración configurada) con estos datos mínimos: - Número de factura y fecha - NIF y nombre del emisor (tú) - NIF y nombre del receptor (cliente empresa) - Importe base, IVA e IRPF (si aplica) - Concepto o descripción breve 3. **La Agencia Tributaria valida** en segundos y asigna un código de envío. 4. **Ambas partes (emisor y receptor) pueden consultar** el registro para reconciliación.

**Punto crítico:** Verifactu es un registro de **datos básicos**, no un almacenamiento de facturas originales. Tú sigues siendo responsable de guardar las facturas originales 5 años según normativa tributaria.

Apps y soluciones para Shopify España que cumplen Verifactu

A día de hoy, **Shopify nativo no integra directamente Verifactu**. Necesitas una solución de terceros. Aquí están las opciones verificadas:

**Crea (creasoftware.com):** Especializada en facturación B2B en España. Integración nativa con Shopify mediante app. Conecta directamente con Verifactu y genera facturas digitales cumpliendo normativa. Permite configurar datos de tu empresa, series de facturación y reportes de auditoría. Precio: desde 20€/mes (plan pequeño empresa). Soporte técnico en español.

**Billdu + integración manual:** Facturación general que se conecta a Shopify. Para Verifactu requiere exportar datos e importarlos manualmente en plataforma certificada. No es automático, implica trabajo manual semanal.

**Gestores online especializados (Holded, Contaplus Cloud):** Son suites contables completas. Pueden integrarse con Shopify mediante Zapier/automatizaciones. Cumplen Verifactu pero tienes sobrecarga de funcionalidades si solo necesitas facturación. Precio más alto (50-100€/mes).

**Marketplace de Shopify App Store:** Actualmente hay pocas apps específicas de Verifactu. Busca en el App Store con términos "Verifactu" o "Facturación B2B España". Verifica que la app tenga certificación oficial de la Agencia Tributaria (no todas lo tienen aún).

**Recomendación:** Para merchants Shopify con volumen B2B moderado, **Crea** es la solución más directa. Para operaciones más complejas (inventario + contabilidad + Verifactu), considera Holded.

Requisitos técnicos y legales para cumplir

Antes de implementar cualquier solución, verifica que cumples estos requisitos:

**Documentación:** - NIF activo y empresa dada de alta en el Impuesto sobre Actividades Económicas (IAE) - Datos de identificación empresarial correctos en Shopify - Certificado digital o Cl@ve (para validar en portal Agencia Tributaria)

**Configuración de facturas en Shopify:** - Cada factura generada debe incluir: número secuencial, fecha, datos emisor/receptor, base imponible, IVA desglosado, IRPF (si procede) - Tienes dos opciones: usar facturación nativa de Shopify (generan PDFs básicos) o app especializada que enlace con Verifactu

**Plazos de reporte:** - Facturas emitidas: comunicar dentro de **3 días hábiles** - Facturas recibidas: comunicar en el mismo plazo (obligación solidaria) - Retrasos conllevan sanciones desde 100€ por factura

**Almacenamiento:** - Guardar originales digitales 5 años - Mantener logs de envío a Verifactu (la app suele hacerlo automáticamente) - Custodiar clave de acceso a portal AEAT

Pasos prácticos para implementar Verifactu en tu Shopify

**Paso 1: Auditar tu modelo de negocio** ¿Vendes principalmente B2B (a empresas) o B2C (consumidor final)? Si es B2B, Verifactu te afecta directamente. Si es mixto, solo las ventas a empresas requieren registro.

**Paso 2: Registrarse como usuario de Verifactu** Ve a la web de la Agencia Tributaria (aeat.es), sección Verifactu. Accede con Cl@ve o certificado digital. Crea usuario y contraseña específicos. Esto toma ~15 minutos.

**Paso 3: Elegir solución de facturación integrada** Evalúa apps en App Store de Shopify o soluciones externas (Crea, Holded). Prioridad: que tengan certificación oficial de AEAT para Verifactu. Solicita demo.

**Paso 4: Instalar y configurar app** Conecta la app a tu tienda Shopify. Autentica con tus datos AEAT. Configura: - Datos de tu empresa (nombre, NIF, domicilio) - Series de facturación (si usas múltiples series) - Retenciones de IRPF (si aplica a tu sector) - Frecuencia de sincronización (diaria o en tiempo real)

**Paso 5: Pruebas y activación** Generá una factura de prueba en tu Shopify. Verifica que se envíe a Verifactu correctamente (la app suele mostrar estado). Descargá el PDF y validá que contenga todos los datos. Una vez confirmado, activa para todas las nuevas órdenes.

Preguntas frecuentes sobre cumplimiento y sanciones

**¿Qué pasa si no registro una factura a tiempo?** La Agencia Tributaria impone sanciones por incumplimiento: desde 100€ por factura no registrada, escalonadas según retraso. En caso de fraude deliberado, las sanciones alcanzan 50% del importe de la factura. Además, genera inconsistencias en auditorías futuras que complican tu posición fiscal.

**¿Tengo que comunicar TODAS las facturas o solo algunas?** Si eres obligado (según fase), tienes que comunicar todas las emitidas Y todas las recibidas (aunque no hayas emitido la factura, si recibes una de un proveedor, debes reportarla). No hay excepciones por importe mínimo.

**¿Verifactu reemplaza mi facturación actual?** No. Verifactu es un registro complementario. Sigues emitiendo facturas en tu software/app de siempre. Solo añades el paso de reportar a Verifactu (que, con integración automática, sucede sin intervención manual).

**¿Mi cliente B2B puede rechazar factura digital?** No. Desde el 2024, la facturación electrónica es obligatoria para todas las transacciones B2B en la UE. Tu cliente debe aceptar formato digital.

**¿Y si mi cliente es extranjero (UE)?** Verifactu aplica solo a transacciones dentro de España. Si vendes a empresa en Italia, Portugal, etc., se rigen por normativas locales. Pero si es empresa con NIF español, entra en Verifactu aunque sea sucursal extranjera.

Errores comunes que debes evitar

**Error 1: Esperar a enero 2026 para empezar** La Agencia Tributaria ya recibe registros voluntarios. Adelantarte ahora te da ventaja: datos históricos validados, menos estrés en la fecha límite, familiarización con el sistema.

**Error 2: Confundir Verifactu con LREE** LREE (Ley de Registros de Facturas Electrónicas) es la normativa anterior (2016-2025). Verifactu la sustituye con exigencias más estrictas. No actualizar tu sistema es un fallo común.

**Error 3: Asumir que tu gestor/asesor se encarga** Si tienes gestor, es su responsabilidad, pero **tú eres responsable solidario** de la comunicación a Verifactu. Verifica en tu contrato que incluye este servicio explícitamente.

**Error 4: Usar facturas manuales o Word/Excel** Shopify genera PDFs automáticos, pero si los editas manualmente después, pierdes trazabilidad. Usa siempre facturas generadas por app integrada con Verifactu.

**Error 5: No validar datos de clientes** Si comunicas factura con NIF incorrecto, la AEAT la rechaza. Implementá validación de NIF en tu proceso de checkout (apps como NIF Validator existen).

Checklist de cumplimiento

Audita tu modelo: ¿generates facturas B2B? Si no, Verifactu no te aplica en Fase 1. Si sí, continúa.
Registrate como usuario en la Agencia Tributaria (aeat.es, sección Verifactu) con tu Cl@ve o certificado digital.
Elige e instala una app de facturación Verifactu compatible con Shopify (Crea es la recomendación para España). Solicita demo antes.
Configura la app con tus datos empresariales (NIF, razón social, series de facturación, retenciones IRPF si aplica). Conecta credenciales AEAT.
Realiza prueba: genera una factura test, verifica que se registre correctamente en Verifactu, descargá PDF y revisa todos los datos (número, NIF cliente, importe, IVA). Una vez confirmado, activa para producción.

Aviso legal

Esta guía es informativa, no es asesoría legal ni fiscal. Para tu caso concreto consulta con tu gestor o asesor. Normativa actualizada según BOE Real Decreto 1007/2023 y Ley 11/2021.

Preguntas frecuentes

¿Es obligatorio Verifactu para todas las tiendas Shopify en España?

Técnicamente, depende de tu modelo de negocio y facturación anual. Si vendes **B2B (a empresas)** y tus ingresos superan el umbral de tu fase (3 millones en 2026, 600k en 2026 segunda mitad, cualquier importe en 2027), sí es obligatorio. Si vendes solo B2C (consumidor final), no. Si eres mixto, solo aplica a la parte B2B. En todo caso, si emites facturas con NIF de cliente, Verifactu te afecta.

¿Desde cuándo es obligatorio registrar en Verifactu?

Depende de tu facturación anual: **1 enero 2026** para empresas con ingresos >3 millones €; **1 julio 2026** para 600k-3 millones €; **1 enero 2027** para el resto (autónomos y PYMEs). Pero la Agencia Tributaria acepta registros voluntarios ya. Si adelantas, esos datos cuentan como histórico válido.

¿Qué app de Shopify cumple con Verifactu y es recomendable?

**Crea** (creasoftware.com) es la solución más directa para Shopify España: integración nativa, generación de facturas digitales, reporte automático a Verifactu, almacenamiento, desde 20€/mes. Holded también funciona pero es más cara (50-100€/mes) y orientada a PYMEs con contabilidad compleja. Verifica que cualquier app tenga certificación oficial AEAT para Verifactu.

¿Qué pasa si no reporto una factura a Verifactu?

Sanciones desde 100€ por factura no registrada, escalonadas según retraso. En auditorías, Hacienda detecta inconsistencias (tienes ingresos pero no facturas reportadas). Esto puede derivar en rechazo de gastos deducibles y multas adicionales. El riesgo fiscal es alto: cumplir es más barato que sanciones.

¿Shopify nativo incluye Verifactu integrado?

No. Shopify genera facturas PDF estándar pero no integra Verifactu automáticamente. Necesitas una app terceros que se conecte con la Agencia Tributaria. Sin app integrada, tendrías que reportar manualmente (tedioso y propenso a errores).

¿Tengo que comunicar también facturas recibidas (de mis proveedores)?

Sí. Verifactu es un sistema de obligación solidaria: como emisor debes reportar tus facturas, y como receptor debes reportar las que recibes. Si recibes factura de proveedor, también tienes que registrarla en Verifactu (tu responsabilidad, no solo la del proveedor).

¿Puedo seguir emitiendo facturas en Word o PDF manual?

Técnicamente sí, pero no es recomendable con Verifactu: pierdes trazabilidad automática, aumentas errores de transcripción, y luego tienes que reportar manualmente (tedioso). Usa siempre software integrado que genere facturas estándar y sincronice con Verifactu.

¿Mi cliente B2B puede rechazar factura digital?

No. Desde 2024, la facturación electrónica es obligatoria para todas las transacciones B2B en España y la UE. Tu cliente debe aceptar PDF/XML digital. No existe exceción por preferencia de formato papel.

¿Necesitas implementarlo?

Conecta con una agencia Shopify especializada en compliance español que te configure Verifactu paso a paso.

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